Saluran pencernaan berfungsi dalam menampung, mencerna serta menyerap makanan. Struktur sistem pencernaan biasanya berkaitan dengan perilaku makan dan jenis pakan. Faktor yang mempengaruhi morfologi sistem pencenaan pada ikan dapat dilihat dari perilaku makan, jenis pakan serta habitat yang berbeda pula Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui bentuk anatomi saluran pencernaan dan struktur histologi lambung dan usus ikan kakatua. Metode penelitian yang dilakukan adalah metode deskriptif terhadap 3 ekor ikan kakatua dan diamati bentuk anatomi dari saluran pencernaan serta menggunakan lambung, usus depan, usus anterior, usus mid dan usus posterior yang diproses secara histoteknik dengan pewarnaan Hematoksilin Eosin (HE) kemudian diamati menggunakan mikroskop digital. Hasil penelitian yang telah dilakukan menunjukkan bahwa saluran pencernaan ikan kakatua terdiri dari empat lapisan yaitu tunika mukosa, submukosa, muskularis dan serosa. Mukosa proventrikulus terdiri atas epitel silindris selapis dan terdapat limfonodus pada lamina propria. Tunika muskularis terdiri dari otot sirkuler. Mukosa usus terdiri dari epitel silindris selapis dan ditemukan sel goblet yang bertambah banyak menuju usus posterior. Tunika muskularis terdiri dari otot sirkuler. Perkiraan koefisien usus rata-rata dan karakteristik sistem pencernaan ikan kakatua menyajikan kecukupan morfologi untuk kebiasaan makan herbivora.