Penelitian ini menyimpulkan pengenbangan pendidikan karakter melalui pendidikan islam Di Perguruan Tinggi Keagamaan Islam Negeri di UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta berjalan dengan pesat, seiring dengan tuntutan dan kewajiban dalam penembangan kurikulum sekarang ini sesuia dengan Peraturan Presiden Republik Indonesia no 8 tahun 2012 yang di dalamnya antara lain mengatur tentang: jenjang, penyetaraan, dan penerapan kualifikasi sumber daya manusia Indonesia. Penelitian ini membahas tentang pendidikan karakter dalam pembelajaran Pendidikan Agama Islam Terintegrasi terhadap mahasiswa. Kajiannya dilatarbelakangi oleh substansi mata pelajaran pendidikan agama Islam yang memiliki kontribusi dalam pembentukan akhlaqul karimah dalam kehidupan sehari- hari dan memahami tentang nilai-nilai keagamaan serta problematika yang dihadapi dalam proses pembelajarannya dalam pembentukan karakter peserta didik. Dari desain perencanaan pembelajaran yang masih berpusat pada mahasiswa, KBM yang terjadi tidak kontekstual dengan kehidupan mahasiswa dan evaluasi yang jarang dilakukan.